【JASN】腎臓組織および常在免疫細胞を研究するための定量的三次元組織サイトメトリー。

腎臓における免疫系の分析は、主にフローサイトメトリーに依存する。強力ではあるが、フローサイトメトリー分析に必要な組織均質化のプロセスはバイアスを導入し、免疫細胞の空間分布を決定するのに必要な形態学的ランドマークを失わせる。理想的なアプローチは、3次元（3D）組織サイトメトリー：インタクトな腎臓組織から収集された3D画像体積における免疫細胞および関連空間パラメータの自動定量化を支持する。しかしながら、このアプローチの広範な応用は、大きな3D顕微鏡データのデジタル分析のためのアクセス可能なソフトウェアツールの欠如によって制限される。ここでは、大規模で複雑な3D顕微鏡データセットの効率的な探査と定量分析のために設計された容積組織探査および分析（VTEA）画像解析ソフトウェアについて説明します。固定された腎臓組織から採取した画像の解析では、VTEAはフローサイトメトリーの結果を複製しながら、腎臓の異なる領域および特定の腎臓構造に関連する免疫細胞の空間分布の詳細な分析を提供した。 VTEAを用いた偏った探索は、樹状細胞上で典型的に発現するマーカーであるCD11Cを発現する管状上皮細胞の集団を発見することを可能にした。最後に、ヒト腎臓生検全体における免疫細胞の大規模定量のためのVTEAの使用を示す。要約すると、VTEAは、動物モデルまたはバイオバンクされたヒト腎臓生検からの腎臓組織の独特なデジタル検査および分析をサポートする単純かつ効果的なツールであることを示す。私たちはVTEAを興味のある研究者が電子ダウンロードで自由に利用できるようにしました。